记者19日从中国农业科学院获悉,深圳农业基因组研究所左课题组会同中科院脑科学与智能技术卓越创新中心、中科院上海营养与健康研究所,根据蛋白质结构预测了基因编辑过程中产生脱靶效应的重要氨基酸, 并在不影响催化活性的情况下对相应的氨基酸进行突变,最终得到单碱基编辑工具,显著降低了基因编辑的非靶标效应。 相关研究结果最近发表在《自然方法》杂志的网上。
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左介绍,crispr/cas9的衍生工具,单碱基编辑技术,可以在不切断dna双链的情况下实现单核苷酸的定向突变,为单碱基突变引起的遗传性疾病的治疗带来了希望。但从2019年开始,其安全性受到质疑。认为单碱基编辑器会导致严重的dna和rna非靶效应,在临床应用中存在安全风险。此前,国内外许多科学家通过各种方式研究了降低基因编辑dna和rna的非靶效应的方法,并取得了一定的进展,但也存在局限性。
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左的基于goti的方法是无限的,不仅可以检测单基编辑工具,还可以检测和提高其他基于zfn、talen和crispr/cas的基因编辑工具的安全性。该团队使用goti和rna-seq来检测dna和rna缺失靶,发现dna和rna缺失靶是独立的,需要同时检测。Ye1-be3-fnls是一款高精度、高活性的单基编辑工具,显著降低了离靶效应,提高了编辑效率。有望应用于遗传病的基因治疗,促进基因编辑的临床应用。(记者简言)
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标题:[科学技术]新工具能显著降低基因编辑脱靶效应
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